군은 방역협의회를 개최하고 방역기술 자문과 상황실을 운영(평일 오전 8시부터 오후 10시, 휴일 오전 9시부터 오후 6시)하고 있으며, 200여 가금 농가에 대한 전담 공무원(64명)을 지정하고 상시예찰 및 집중 관리를 실시하고 있다.
또한 AI 특별방역대책 중점추진을 위해 거점 소독시설 3개소(아산, 흥덕, 대산)를 설치해 24시간 축산관련이동차량 소독 후 소독필증을 발급하고 관내 축산농가에 출입할 수 있도록 하고 있으며, 고창부안축협과 함께 공동방제단을 운영하며 전통시장 닭집, 가금류 사육농가 등 케이지 소독을 강화했다.
오리농가에 대해서는 입식 전·출하 전 검사를 통해 감염 여부뿐만 아니라 축사 소독 환경 상태를 확인하고, 가든형 오리 사육장 소독과 철새 도래지(동림저수지) 예찰 및 질병취약 지구를 집중 소독·관리하고 있다.
구제역 예방접종은 오는 11월 6일까지 총 664호/1만 2898두(전업농 215호/1만 534두 소규모 449호/2364두)에 대해 정기접종을 실시한다.