제99회 전국체육대회 종합시상식은 폐회식이 치러지는 다음 달 18일 오후 6시 익산종합운동장에서 진행된다.
경기 종목별 시상은 각 종별, 부문별로 이뤄진다.
대회 종료 뒤 해당 회원 종목단체에서 메달 및 상배(트로피)를 입상 선수 및 단체에게 전달한다. 상장은 종목별 경기가 끝난 뒤, 대회운영본부에서 각 시·도체육회를 통해 배부할 예정이다.
체전 마지막 날 경기가 끝나는 종목의 경우 우편으로 해당 시·도체육회에 상장을 보낸다.